分公司独立核算是指企业将自身每个分公司进行独立核算，即每个分公司开设独立的账户，独立管理企业分支机构的资产和负债、收入和支出等。
账务处理方面，首先应当通过完成公司中央总部到各分公司的资金结算，确认企业分支机构的应收账款和应付账款，以及与分支机构的应收账款和应付账款的交易。其次，完成企业分支机构之间金额调拨，完成企业与分支机构之间的产品调拨，完成分支机构应收账款和应付账款的记录等，都应当进行账务处理。最后，应当保证各分支机构的资产负债信息、收支信息的准确性，以及分支机构的财务报表的正确性，确保会计核算的准确性。
拓展知识：分公司独立核算的优势在于，可以更加完整的囊括企业每个分支机构的资金情况，更好的控制企业资金的流动，从而提高企业资金管理的效率，避免资金流失。